Proteobacteria sind eiweißabbauende Bakterien mit Anteilen 4-9% im gesunden Mikrobiom. Höhere Werte sind unerwünscht und mittelfristig mit Nierenproblemen, Aminbildung sowie Ammoniakbildung assoziiert.

Durchfall, Blähungen oder Verstopfung sind aus Sicht der Mikrobiomforschung primär Hinweise auf entzündliche Darmerkrankungen, veränderte Muzinbildung und Dysbalancen bei darmwichtigen Bakterien wie Faecalibacteria und Akkermansia.

Im Mikrobiom der Säuger koexistieren Dickmacher-Bakterien (Firmicutes) und Schlankmacher-Bakterien (Bacteroidetes). Diese sollten 90% aller Bakterien im Mikrobiom abbilden. Zugleich stehen sie in einer gesunden Balance zueinander - bei gesunden Tieren. Anhand der Abweichungen kann man die Futterration entsprechend optimieren und Adipositas entgegenwirken, indem man die Schlankmacherbakterien fördert und füttert. Das Ziel einer hohen Futtereffizienz liegt in einer Balancierung des Darm-Mikrobioms der Zootiere.

Aus der Humanmedizin werden drei Ernährungstypen abgebildet: Fleischesser haben ein Mikrobiom mit Schwerpunkt auf Bacteroides, Pflanzenfresser mit Schwerpunkt auf Prevotella-Arten und Mischköstler mit Schwerpunkt auf Ruminococcus-Arten. Jeder dieser Typen hat Vorteile, aber auch Nachteile. So kann der Fleischesser Vitamine besser verstoffwechseln, der Pflanzenfresser tendiert dagegen zu Vitaminproblemen, die oft nicht durch Nahrungsergänzung ausreichend supplementiert werden können. Der Mischtyp zeigt sich häufig mit günstigeren Werten. In der Praxis neigen Bacteroides-Dominanz zur Adipositas und Prevotella-Dominanz zu schlanken Tieren. Manchmal sind die Tiere übergewichtig trotz vermeintlich guter Fütterung, parallel liegen dann oft Bacteroides und Prevotella mit ähnlichen Anteilen vor. Sie kämpfen um dieselben Nährstoffe. In solchen Fällen genügt es meist, den Bacteroides weniger Nahrung zu geben und die Prevotella etwas zu fördern. Häufig nehmen die Tiere dann ab - ohne besondere Diät.

Dysbalancen im Mikrobiom führen zunächst zu reversiblen Veränderungen an der Mucinschicht, zu silent inflammation oder silent intoxication. Diese dezenten Veränderungen im Entzündungsgeschehen werden im Praxisalltag nur bedingt erfaßt, erzeugen aber im Laufe der Zeit manifeste Folgeerkrankungen wie Herzerkrankungen, Diabetes, Leberschäden, entzündliche Darmerkrankungen. Der Gehalt an Vitamin B12 sinkt, somit steigt auch ROS, die freien Radikale und es kommt zu vermehrtem Zellfraß. Mikrobiom-Analysen erfassen solche Tendenzen frühzeitig und deutlich sensibler als mit crp im Blut, auch Indikatoren für silent inflammation lassen sich leicht finden.

Bei vermeintlich günstiger Fütterungslage mit hohen Fasergehalten kann es von Tier zu Tier individuell zu Störungen im Mikrobiom kommen, die eigentlich nicht vorkommen dürften. So kann z.B. ein Fleischfresser über ein Mikrobiom verfügen, das eigentlich einem Pflanzenfresser entsprechen würde. Nach genauer Kenntnis der vorliegend störenden Bakterien kann das Mikrobiom neu balanciert werden und die Tiergesundheit gefördert werden.

Hier kann es sich natürlich um eine Erkrankung oder ein Futterproblem handeln. Wir sehen hier jedoch auch häufig ein Vitamin B-12 Mangelproblem oder eine B-12 Verwertungsstörung aus der entsprechende Antriebslosigkeit resultieren könnte. Sehr gut bioverfügbare Cobalamine könnten substituiert werden. In vielen Fällen reicht es aus, die Vitamin-B12- verarbeitenden Bakterien wie Pseudomonas im Mikrobiom gezielt zu fördern.